晋江市医院晋南分院前身龙湖镇卫生院，始建于1958年，2005年晋江市委、市政府根据全市医疗资源的布局需要撤龙湖镇卫生院设立晋江市医院晋南分院。2006年6月，晋江市医院管理组成员入驻，医院进入全新的快速发展阶段。
     目前，医院已从薄弱的乙类卫生院成长成一家二级甲等综合性医院。业务发展迅速，专业科室设置日趋齐全，从2006年的54人扩增到现在330人，卫生技术人员数290（医师129人、护理人员120人、医技人数41人）。副高以上职称人员21人，中级职称49人。
全院设有17个临床科室，10个医技科室，10个职能管理部门以及120急救分中心与公共卫生科。2010年底新住院部大楼竣工投入使用，医院增设内科、外科、妇产科、儿科、急诊科等病区，开放床位数也由原来的75张增加到305张；同时医院就诊的患者也与日俱增，年门诊量从6.5万人增长到2014年35.8万人；住院病人量从3534人次增长到11510人次；医院收入保持9年快速增长，2014年医院总收入突破亿元；大病、急危重病的就诊率也不断攀升。
大型设备主要有：16排CT、岛津DR、C臂机、彩超、便携彩超、B超、脑彩超、全自动生化仪、发光免疫分析仪、酶标仪、全自动五分类血球分析仪、血凝仪、尿液分析仪、动态心电图、动态血压图、胃镜、肠镜、膀胱镜、阴道镜、腹腔镜、胆道镜、电切镜、碎石机、肺功能仪、点阵激光治疗仪、呼吸末CO2监护仪、除颤起博器、电动洗刀等大型医疗设备70多件，配有百级洁净手术室，网络HIS系统（含LIS），还有新配的整体实验室与供应室。
医院占地面积100043.83㎡，是原来的4倍，建筑总面积从5330㎡增加到26310.46㎡。2012年12月我院顺利地通过二级甲等综合性医院的评审，2014年9月被晋江市政府确定为“晋江市惠民医院”实施公立医院改革惠民工作，让更多的群众得到公改的实惠。
同时，我院还是晋兴职业中专学校药剂专业教学实验基地。承担《面颅骨微细或隐匿性骨折的价值研究》、《肺炎支原体在患儿与家庭密切接触者之间的相关性研究》、《呼出气一氧化氮（eNO）与喘息之间的相关性研究》等多个科研课题的研究。2014年获得两项专利。